输卵管结核在临床上的治疗原则是以药物治疗原则为主，绝大部分就是按照系统的早期规律的给予用药，经过大约9个月左右的时间都能达到相对比较稳定的目的。临床上常用的就是异烟肼，还有链霉素，还有对氨基水杨酸钠三联用药给予治疗。
在临床上下列情况可以采用手术的方法给予治疗，比如说如果是由于输卵管结核在局部形成的包块，经过用药治疗之后没有完全消退可以采用手术的方法给予治疗。另外就是通过正规的抗结核治疗，在临床上出现反复发作的也建议做手术给予治疗。再有一个就是如果在局部已经形成了比较大的包裹性积液的情况下建议手术给予治疗。
