关于同治帝的死因，一直以来就始终有着天花病死和梅毒病死两种说法，清朝的官方史书和各种档案都明确记载这同治皇帝死于天花，一些也是传闻和杂记却都记载着同治皇帝死于梅毒。除此之外，还有一种说法，说是慈禧太后得知同治帝染上了梅毒，但为了保全皇家颜面，慈禧密令太医按照治天花的方法治疗同治帝的梅毒，结果自然是越治越重，最终不治而亡，也有人说是慈禧害死了同治皇帝。
一、慈禧害死说
同治皇帝是清朝历史上第三位小皇帝，作为咸丰帝唯一活下来的儿子，同治帝的即位可以说是毫无悬念的，这也造成了他从小顽劣的性格，我们都知道慈禧太后对同治帝的高压管理是造成了同治帝人生悲剧的根源。但慈禧必竟是一位母亲，她对于同治皇帝的高压管控背后更多的是恨铁不成钢的无奈，要说慈禧太后想让自己的儿子死，这是没有根据的，同治帝并没有做出大逆不道的事情让慈禧害死他，况且当时不仅有慈禧一位皇太后，同治帝的嫡母慈安太后当时尚在，要知道，整个同治时期，慈安太后才是一切朝政大事的最终裁决者，慈禧要想在慈安太后眼皮子底下做出害死的同治帝的事情，简直比登天还难。
二、梅毒致死说
不可否认的是，因为其母慈禧太后的缘故，同治皇帝的婚姻确实是不幸福的，尽管他有一后四妃，他喜欢的皇后却不能和他在一起，而慈禧太后偏要同治帝宠幸他并不喜欢的慧妃。以至于同治皇帝经常负气独自居住在乾清宫，后来甚至在恭亲王长子载澄的撺掇下出宫嫖妓并染上梅毒，最终不治而死。关于此种记载，不见于清宫档案和清史之中，不过如果此系属实，那么这就是一桩皇家丑闻，作为官方记录者的史官怎么会不替皇家遮丑呢？那些所谓的实录、历史，实际上都是可以由当事人或者后人改写的。
三、天花致死说
根据清朝官方的记载，同治皇帝最终是死于了天花不治的。年仅十九岁的他成为了清朝最短命的皇帝。其实同治帝的死亡还有一个深层的原因，那就是满洲人长期以来的数代人的近亲结婚。长期的近亲结婚使得清朝皇室自乾隆以后就子嗣不旺，婴儿夭折率很高，很多皇子皇女都活不到成年。作为咸丰帝唯一儿子的同治帝去世时甚至没留下一个儿女。
慈禧太后一生视权力如生命，任何人不管是谁只要动了老太太的权力都会被她毫不犹豫的铲除，也正因为如此，清朝晚期宫中很多人的死亡都将矛头对准了慈禧。慈安太后的死被认为是慈禧太后一手所致；嘉顺皇后的去世被认为是慈禧所逼；珍妃的投井被认为是慈禧所导演；光绪帝的暴死也被认为是慈禧太后下的毒。这些事情虽然都或多或少与慈禧太后有些关系，大多都是往慈禧身上泼脏水。同治帝的死亡，作为母亲的慈禧太后固然有着不可推卸的责任，要说是慈禧害死同治皇帝，我觉得还是很冤枉的。
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