1、安全性不同
转基因食用油由于在转基因过程中，可能有不可预见的基因突变，所以食用转基因大豆生产的食用油可能会给人体带来危害 ；
非转基因食用油用天然大豆制作食用油，更安全可靠；
2、原料不同
转基因食用油 转基因食物油的原料是转抗除草剂基因或者抗虫基因的转基因作物 ；
非转基因食用油非转基因食物油的原料是天然的农作物；
3、营养价值不同
转基因食用油转基因食用油营养价值相对较低，缺乏对人体有益的黄硐素；
非转基因食用油非转基因食用油本身的营养含量成分比较齐全，有大量人类所需的不饱和酸。
