1991年，在拍摄《火箭专家》时，詹妮弗·康纳利与男主角比尔·坎贝尔相恋，1996年分手。
1997年，詹妮弗·康纳利与摄影师戴维·杜根相恋，并产下一子凯，之后两人感情破裂。
2001年，詹妮弗·康纳利与演员乔西·查尔斯相恋，2002年4月分手。
2002年底，詹妮弗·康纳利与英国演员保罗·贝塔尼订婚，并于圣诞节期间秘密结婚。2003年8月，两人的儿子Stellan出生。2011年5月31日，詹妮弗·康纳利生下女儿阿格尼斯（Agnes）
